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新肿瘤功能基因研究线路

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CCK8

Cell Counting Kit-8(简称 CCK-8)试剂可用于简便而准确的细胞增殖和毒性分析。其基本原理为:该试剂中含有 WST-8【化学名:2-(2-甲氧基-4-硝基苯基)-3-(4-硝基苯基)-5-(2,4- 二磺酸苯)-2H-四唑单钠盐】,它在电子载体 1-甲氧基-5-甲基吩嗪鎓硫酸二甲酯(1-Methoxy PMS)的作用下被细胞中的脱氢酶还原为具有高度水溶性的黄色甲瓒产物(Formazan dye)。生成的甲瓒物的数量与活细胞的数量成正比。用酶标仪在 450nm 波长处测定其吸收值,因此可利用这一特性直接进行细胞增殖和毒性分析。MTT现在较为少用。

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用目的基因shRNA慢病毒感染Hep3B细胞,3天后收集细胞,按1500/孔的细胞数量接种细胞至96孔板,第二天待细胞贴壁后,开始进行CCK8检测,连续检测5天,获得细胞增殖曲线。结果显示,shRNA下调目的基因表达后,细胞增殖显著减缓,表明目的基因与Hep3B细胞增殖显著相关。


克隆形成

细胞克隆形成率即细胞接种存活率,表示接种细胞后贴壁的细胞成活并形成克隆的数量。贴壁后的细胞不一定每个都能增殖和形成克隆,而形成克隆的细胞必为贴壁和有增殖活力的细胞。克隆形成率反映细胞群体依赖性和增殖能力两个重要性状。

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用目的基因shRNA慢病毒感染Hep3B细胞,3天后收集细胞,按1000/孔的细胞数量接种细胞至6孔板,进行细胞克隆实验,shRNA下调目的基因表达后,细胞克隆能力减弱,表明目的基因与Hep3B细胞克隆能力相关。


Transwell

血清中某些成分,如一些细胞因子,对细胞生长来说是必不可少的,因此细胞对这些因子具有趋向性,利用Transwell小室,将细胞与含血清的培养基隔离,利用细胞的这种趋性来促使细胞迁移。细胞迁移是肿瘤转移的一个重要指标,通过测量细胞的转移能力来衡量肿瘤转移迁移能力。

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用目的基因shRNA慢病毒感染Hep3B细胞,3天后收集细胞,按5000/孔的细胞数量接种细胞至Transwell小室,进行细迁移侵袭实验,shRNA下调目的基因表达后,细胞迁移侵袭能力减弱,表明目的基因与Hep3B细胞迁移侵袭能力相关。


划痕实验

创伤愈合实验是一种简单、廉价的方法,也是最早发展起来的研究定向细胞在体外迁移的方法之一。该方法模拟了细胞在体内愈合过程中的迁移过程。基本步骤包括在细胞单层中创建一个“伤口”,在细胞迁移过程中在开始和定期捕获图像以关闭伤口,以及比较图像以确定细胞迁移速率。

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用目的基因shRNA慢病毒感染Hep3B细胞,3天后收集细胞,按5万/孔的细胞数量接种细胞至24孔板,进行细胞划痕实验,shRNA下调目的基因表达后,细胞划痕愈合能力减弱,表明目的基因与Hep3B细胞迁移能力相关。


细胞凋亡

在正常细胞中,磷脂酰丝氨酸(PS)只分布在细胞膜脂质双层的内侧,而在细胞凋亡 早期,细胞膜中的磷脂酰丝氨酸(PS)由脂膜内侧翻向外侧。Annexin V 是一种分子量为 35~36kD 的 Ca2+依赖性磷脂结合蛋白,与磷脂酰丝氨酸有高度亲和力,故可通过细胞外侧暴露的磷脂酰丝氨酸与凋亡早期细胞的胞膜结合。因此 Annexin V 被作为检测细胞早期凋亡 的灵敏指标之一。将 Annexin V 进行荧光素(EGFP、FITC)标记,以标记了的 Annexin V 作为荧光探针,利用荧光显微镜或流式细胞仪可检测细胞凋亡的发生。与 FITC 的绿色荧光 信号相比,EGFP 的绿色荧光信号具有信号强,不易淬灭,稳定性高等优点,故本试剂盒采 用 EGFP 作为荧光标记探针。碘化丙啶(Propidium Iodide, PI)是一种核酸染料,它不能透过完整的细胞膜,但对凋亡中晚期的细胞和死细胞,PI 能够透过细胞膜而使细胞核染红。 因此将 Annexin V 与 PI 匹配使用,就可以将处于不同凋亡时期的细胞区分开来。

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用目的基因shRNA慢病毒感染Hep3B细胞,3天后收集细胞,按5万/孔的细胞数量接种细胞至6孔板,Annexin V/PI双染法流式检测细胞凋亡,shRNA下调目的基因表达后,细胞凋亡增加显著,表明目的基因与Hep3B细胞凋亡相关。


细胞周期

碘化丙啶(Propidium ,简称PI)是一种双链DNA的荧光染料。碘化丙啶和双链DNA结合后可以产生荧光,并且荧光强度和双链DNA的含量成正比。细胞内的DNA被碘化丙啶染色后,可以用流式细胞仪对细胞进行DNA含量测定,然后根据DNA含量的分布情况,可以进行细胞周期和细胞凋亡分析。

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用目的基因shRNA慢病毒感染Hep3B细胞,3天后收集细胞,按5万/孔的细胞数量接种细胞至6孔板,PI单染法流式检测细胞周期,shRNA下调目的基因表达后,细胞在G1期显著阻滞,表明目的基因与Hep3B细胞周期调节相关。


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